Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJW6

Alyref2, Aly/REF export factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alyref2Q9JJW6 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Alyref2Q9JJW6 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Alyref2Q9JJW6 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Alyref2Q9JJW6 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Alyref2Q9JJW6 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Alyref2Q9JJW6 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Alyref2Q9JJW6 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Alyref2Q9JJW6 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Alyref2Q9JJW6 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Alyref2Q9JJW6 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Alyref2Q9JJW6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Alyref2Q9JJW6 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms