Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms