Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim39Q9ESN2 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim39Q9ESN2 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim39Q9ESN2 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Trim39Q9ESN2 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Trim39Q9ESN2 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim39Q9ESN2 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim39Q9ESN2 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Trim39Q9ESN2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim39Q9ESN2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim39Q9ESN2 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim39Q9ESN2 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim39Q9ESN2 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim39Q9ESN2 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim39Q9ESN2 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim39Q9ESN2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim39Q9ESN2 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim39Q9ESN2 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim39Q9ESN2 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim39Q9ESN2 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim39Q9ESN2 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim39Q9ESN2 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim39Q9ESN2 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Trim39Q9ESN2 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim39Q9ESN2 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Trim39Q9ESN2 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Trim39Q9ESN2 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim39Q9ESN2 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim39Q9ESN2 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim39Q9ESN2 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim39Q9ESN2 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim39Q9ESN2 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim39Q9ESN2 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim39Q9ESN2 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Trim39Q9ESN2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Trim39Q9ESN2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Trim39Q9ESN2 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim39Q9ESN2 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim39Q9ESN2 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim39Q9ESN2 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Trim39Q9ESN2 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim39Q9ESN2 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim39Q9ESN2 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Trim39Q9ESN2 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Trim39Q9ESN2 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim39Q9ESN2 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim39Q9ESN2 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim39Q9ESN2 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim39Q9ESN2 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim39Q9ESN2 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim39Q9ESN2 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim39Q9ESN2 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim39Q9ESN2 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim39Q9ESN2 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim39Q9ESN2 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim39Q9ESN2 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim39Q9ESN2 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim39Q9ESN2 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim39Q9ESN2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim39Q9ESN2 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim39Q9ESN2 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim39Q9ESN2 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim39Q9ESN2 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Trim39Q9ESN2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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