Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp29Q9ES63 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms