Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH7

Hipk3, Homeodomain-interacting protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk3Q9ERH7 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hipk3Q9ERH7 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hipk3Q9ERH7 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms