Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB0

Snap29, Synaptosomal-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap29Q9ERB0 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snap29Q9ERB0 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms