Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQR4

Clca3a2, Chloride channel accessory 3A2, mousemouse

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Length 902 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3a2Q9EQR4 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clca3a2Q9EQR4 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca3a2Q9EQR4 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca3a2Q9EQR4 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca3a2Q9EQR4 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca3a2Q9EQR4 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca3a2Q9EQR4 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca3a2Q9EQR4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca3a2Q9EQR4 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca3a2Q9EQR4 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca3a2Q9EQR4 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca3a2Q9EQR4 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca3a2Q9EQR4 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca3a2Q9EQR4 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca3a2Q9EQR4 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca3a2Q9EQR4 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca3a2Q9EQR4 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca3a2Q9EQR4 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca3a2Q9EQR4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca3a2Q9EQR4 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca3a2Q9EQR4 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca3a2Q9EQR4 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca3a2Q9EQR4 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca3a2Q9EQR4 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca3a2Q9EQR4 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca3a2Q9EQR4 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca3a2Q9EQR4 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca3a2Q9EQR4 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca3a2Q9EQR4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca3a2Q9EQR4 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca3a2Q9EQR4 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca3a2Q9EQR4 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca3a2Q9EQR4 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca3a2Q9EQR4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca3a2Q9EQR4 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Clca3a2Q9EQR4 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clca3a2Q9EQR4 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clca3a2Q9EQR4 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clca3a2Q9EQR4 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clca3a2Q9EQR4 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clca3a2Q9EQR4 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clca3a2Q9EQR4 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clca3a2Q9EQR4 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clca3a2Q9EQR4 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clca3a2Q9EQR4 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clca3a2Q9EQR4 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clca3a2Q9EQR4 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clca3a2Q9EQR4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clca3a2Q9EQR4 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clca3a2Q9EQR4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clca3a2Q9EQR4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clca3a2Q9EQR4 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clca3a2Q9EQR4 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clca3a2Q9EQR4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clca3a2Q9EQR4 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clca3a2Q9EQR4 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clca3a2Q9EQR4 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clca3a2Q9EQR4 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Clca3a2Q9EQR4 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca3a2Q9EQR4 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca3a2Q9EQR4 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca3a2Q9EQR4 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca3a2Q9EQR4 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca3a2Q9EQR4 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca3a2Q9EQR4 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca3a2Q9EQR4 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca3a2Q9EQR4 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca3a2Q9EQR4 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca3a2Q9EQR4 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca3a2Q9EQR4 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca3a2Q9EQR4 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca3a2Q9EQR4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca3a2Q9EQR4 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca3a2Q9EQR4 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca3a2Q9EQR4 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca3a2Q9EQR4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca3a2Q9EQR4 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca3a2Q9EQR4 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca3a2Q9EQR4 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca3a2Q9EQR4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca3a2Q9EQR4 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca3a2Q9EQR4 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca3a2Q9EQR4 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca3a2Q9EQR4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca3a2Q9EQR4 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca3a2Q9EQR4 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca3a2Q9EQR4 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca3a2Q9EQR4 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca3a2Q9EQR4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca3a2Q9EQR4 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Clca3a2Q9EQR4 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca3a2Q9EQR4 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca3a2Q9EQR4 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca3a2Q9EQR4 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca3a2Q9EQR4 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca3a2Q9EQR4 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca3a2Q9EQR4 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca3a2Q9EQR4 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca3a2Q9EQR4 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Clca3a2Q9EQR4 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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