Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQI5

Ppbp, Chemokine (C-X-C motif) ligand 7, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpbpQ9EQI5 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PpbpQ9EQI5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms