Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH7

Ndst3, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 3, mousemouse

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst3Q9EQH7 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndst3Q9EQH7 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndst3Q9EQH7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ndst3Q9EQH7 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndst3Q9EQH7 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndst3Q9EQH7 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndst3Q9EQH7 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndst3Q9EQH7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndst3Q9EQH7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndst3Q9EQH7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndst3Q9EQH7 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndst3Q9EQH7 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndst3Q9EQH7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndst3Q9EQH7 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndst3Q9EQH7 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndst3Q9EQH7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndst3Q9EQH7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Ndst3Q9EQH7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndst3Q9EQH7 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndst3Q9EQH7 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndst3Q9EQH7 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ndst3Q9EQH7 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndst3Q9EQH7 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndst3Q9EQH7 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndst3Q9EQH7 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndst3Q9EQH7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndst3Q9EQH7 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndst3Q9EQH7 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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Ndst3Q9EQH7 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndst3Q9EQH7 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndst3Q9EQH7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndst3Q9EQH7 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndst3Q9EQH7 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndst3Q9EQH7 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndst3Q9EQH7 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndst3Q9EQH7 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndst3Q9EQH7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndst3Q9EQH7 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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Ndst3Q9EQH7 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndst3Q9EQH7 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndst3Q9EQH7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndst3Q9EQH7 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ndst3Q9EQH7 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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Ndst3Q9EQH7 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndst3Q9EQH7 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ndst3Q9EQH7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
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Ndst3Q9EQH7 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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Ndst3Q9EQH7 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ndst3Q9EQH7 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ndst3Q9EQH7 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ndst3Q9EQH7 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ndst3Q9EQH7 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ndst3Q9EQH7 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ndst3Q9EQH7 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
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Ndst3Q9EQH7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ndst3Q9EQH7 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ndst3Q9EQH7 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ndst3Q9EQH7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ndst3Q9EQH7 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ndst3Q9EQH7 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ndst3Q9EQH7 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ndst3Q9EQH7 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ndst3Q9EQH7 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ndst3Q9EQH7 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ndst3Q9EQH7 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ndst3Q9EQH7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ndst3Q9EQH7 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ndst3Q9EQH7 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndst3Q9EQH7 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndst3Q9EQH7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndst3Q9EQH7 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndst3Q9EQH7 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ndst3Q9EQH7 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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