Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCT2

Ndufs3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs3Q9DCT2 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ndufs3Q9DCT2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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