Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hmg20aQ9DC33 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hmg20aQ9DC33 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms