Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
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