Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rnf6Q9DBU5 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf6Q9DBU5 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms