Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms