Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAT5

Trmu, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrmuQ9DAT5 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TrmuQ9DAT5 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms