Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAA6

Exosc1, Exosome complex component CSL4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc1Q9DAA6 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Exosc1Q9DAA6 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Exosc1Q9DAA6 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Exosc1Q9DAA6 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Exosc1Q9DAA6 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Exosc1Q9DAA6 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Exosc1Q9DAA6 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Exosc1Q9DAA6 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Exosc1Q9DAA6 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Exosc1Q9DAA6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Exosc1Q9DAA6 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Exosc1Q9DAA6 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Exosc1Q9DAA6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Exosc1Q9DAA6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Exosc1Q9DAA6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Exosc1Q9DAA6 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Exosc1Q9DAA6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Exosc1Q9DAA6 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Exosc1Q9DAA6 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Exosc1Q9DAA6 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Exosc1Q9DAA6 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Exosc1Q9DAA6 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Exosc1Q9DAA6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Exosc1Q9DAA6 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Exosc1Q9DAA6 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Exosc1Q9DAA6 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Exosc1Q9DAA6 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Exosc1Q9DAA6 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Exosc1Q9DAA6 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Exosc1Q9DAA6 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Exosc1Q9DAA6 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Exosc1Q9DAA6 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Exosc1Q9DAA6 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Exosc1Q9DAA6 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Exosc1Q9DAA6 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Exosc1Q9DAA6 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Exosc1Q9DAA6 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Exosc1Q9DAA6 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Exosc1Q9DAA6 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Exosc1Q9DAA6 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Exosc1Q9DAA6 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Exosc1Q9DAA6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Exosc1Q9DAA6 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Exosc1Q9DAA6 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Exosc1Q9DAA6 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Exosc1Q9DAA6 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Exosc1Q9DAA6 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Exosc1Q9DAA6 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Exosc1Q9DAA6 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Exosc1Q9DAA6 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Exosc1Q9DAA6 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Exosc1Q9DAA6 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Exosc1Q9DAA6 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Exosc1Q9DAA6 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Exosc1Q9DAA6 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Exosc1Q9DAA6 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Exosc1Q9DAA6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Exosc1Q9DAA6 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Exosc1Q9DAA6 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Exosc1Q9DAA6 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Exosc1Q9DAA6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Exosc1Q9DAA6 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Exosc1Q9DAA6 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Exosc1Q9DAA6 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Exosc1Q9DAA6 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Exosc1Q9DAA6 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Exosc1Q9DAA6 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Exosc1Q9DAA6 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Exosc1Q9DAA6 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Exosc1Q9DAA6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Exosc1Q9DAA6 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Exosc1Q9DAA6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Exosc1Q9DAA6 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Exosc1Q9DAA6 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Exosc1Q9DAA6 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Exosc1Q9DAA6 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Exosc1Q9DAA6 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Exosc1Q9DAA6 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Exosc1Q9DAA6 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Exosc1Q9DAA6 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Exosc1Q9DAA6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Exosc1Q9DAA6 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms