Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9J3

Actrt1, Actin-related protein T1, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt1Q9D9J3 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actrt1Q9D9J3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms