Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D5

Tmco5a, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5aQ9D9D5 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmco5aQ9D9D5 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmco5aQ9D9D5 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmco5aQ9D9D5 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmco5aQ9D9D5 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmco5aQ9D9D5 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmco5aQ9D9D5 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmco5aQ9D9D5 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmco5aQ9D9D5 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmco5aQ9D9D5 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmco5aQ9D9D5 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmco5aQ9D9D5 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmco5aQ9D9D5 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmco5aQ9D9D5 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmco5aQ9D9D5 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmco5aQ9D9D5 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmco5aQ9D9D5 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmco5aQ9D9D5 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmco5aQ9D9D5 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmco5aQ9D9D5 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmco5aQ9D9D5 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmco5aQ9D9D5 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmco5aQ9D9D5 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmco5aQ9D9D5 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmco5aQ9D9D5 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmco5aQ9D9D5 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmco5aQ9D9D5 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmco5aQ9D9D5 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmco5aQ9D9D5 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmco5aQ9D9D5 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmco5aQ9D9D5 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmco5aQ9D9D5 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmco5aQ9D9D5 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmco5aQ9D9D5 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmco5aQ9D9D5 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmco5aQ9D9D5 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmco5aQ9D9D5 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmco5aQ9D9D5 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmco5aQ9D9D5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmco5aQ9D9D5 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmco5aQ9D9D5 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmco5aQ9D9D5 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmco5aQ9D9D5 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmco5aQ9D9D5 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmco5aQ9D9D5 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmco5aQ9D9D5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmco5aQ9D9D5 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmco5aQ9D9D5 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmco5aQ9D9D5 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmco5aQ9D9D5 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmco5aQ9D9D5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmco5aQ9D9D5 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmco5aQ9D9D5 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmco5aQ9D9D5 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmco5aQ9D9D5 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmco5aQ9D9D5 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmco5aQ9D9D5 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmco5aQ9D9D5 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmco5aQ9D9D5 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmco5aQ9D9D5 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmco5aQ9D9D5 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmco5aQ9D9D5 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmco5aQ9D9D5 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmco5aQ9D9D5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmco5aQ9D9D5 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmco5aQ9D9D5 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmco5aQ9D9D5 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmco5aQ9D9D5 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmco5aQ9D9D5 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmco5aQ9D9D5 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmco5aQ9D9D5 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmco5aQ9D9D5 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmco5aQ9D9D5 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmco5aQ9D9D5 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmco5aQ9D9D5 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmco5aQ9D9D5 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmco5aQ9D9D5 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmco5aQ9D9D5 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmco5aQ9D9D5 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmco5aQ9D9D5 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmco5aQ9D9D5 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmco5aQ9D9D5 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmco5aQ9D9D5 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmco5aQ9D9D5 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmco5aQ9D9D5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmco5aQ9D9D5 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmco5aQ9D9D5 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmco5aQ9D9D5 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmco5aQ9D9D5 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmco5aQ9D9D5 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmco5aQ9D9D5 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmco5aQ9D9D5 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmco5aQ9D9D5 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmco5aQ9D9D5 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmco5aQ9D9D5 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmco5aQ9D9D5 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmco5aQ9D9D5 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmco5aQ9D9D5 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmco5aQ9D9D5 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmco5aQ9D9D5 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms