Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8V0

Hm13, Minor histocompatibility antigen H13, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hm13Q9D8V0 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hm13Q9D8V0 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hm13Q9D8V0 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Hm13Q9D8V0 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hm13Q9D8V0 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hm13Q9D8V0 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hm13Q9D8V0 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hm13Q9D8V0 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hm13Q9D8V0 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hm13Q9D8V0 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hm13Q9D8V0 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hm13Q9D8V0 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hm13Q9D8V0 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hm13Q9D8V0 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hm13Q9D8V0 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hm13Q9D8V0 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hm13Q9D8V0 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hm13Q9D8V0 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hm13Q9D8V0 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hm13Q9D8V0 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hm13Q9D8V0 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hm13Q9D8V0 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hm13Q9D8V0 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hm13Q9D8V0 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hm13Q9D8V0 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hm13Q9D8V0 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hm13Q9D8V0 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hm13Q9D8V0 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hm13Q9D8V0 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hm13Q9D8V0 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hm13Q9D8V0 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hm13Q9D8V0 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hm13Q9D8V0 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Hm13Q9D8V0 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hm13Q9D8V0 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hm13Q9D8V0 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hm13Q9D8V0 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hm13Q9D8V0 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hm13Q9D8V0 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hm13Q9D8V0 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hm13Q9D8V0 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hm13Q9D8V0 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hm13Q9D8V0 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hm13Q9D8V0 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hm13Q9D8V0 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hm13Q9D8V0 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hm13Q9D8V0 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hm13Q9D8V0 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Hm13Q9D8V0 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hm13Q9D8V0 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Hm13Q9D8V0 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hm13Q9D8V0 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hm13Q9D8V0 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hm13Q9D8V0 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hm13Q9D8V0 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hm13Q9D8V0 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hm13Q9D8V0 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hm13Q9D8V0 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hm13Q9D8V0 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hm13Q9D8V0 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hm13Q9D8V0 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hm13Q9D8V0 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hm13Q9D8V0 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hm13Q9D8V0 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hm13Q9D8V0 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hm13Q9D8V0 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hm13Q9D8V0 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hm13Q9D8V0 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hm13Q9D8V0 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms