Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms