Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S4

Rexo2, Oligoribonuclease, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo2Q9D8S4 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rexo2Q9D8S4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rexo2Q9D8S4 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rexo2Q9D8S4 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rexo2Q9D8S4 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rexo2Q9D8S4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rexo2Q9D8S4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rexo2Q9D8S4 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rexo2Q9D8S4 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rexo2Q9D8S4 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rexo2Q9D8S4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rexo2Q9D8S4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rexo2Q9D8S4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rexo2Q9D8S4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rexo2Q9D8S4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rexo2Q9D8S4 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rexo2Q9D8S4 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rexo2Q9D8S4 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rexo2Q9D8S4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rexo2Q9D8S4 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rexo2Q9D8S4 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rexo2Q9D8S4 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rexo2Q9D8S4 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rexo2Q9D8S4 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rexo2Q9D8S4 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rexo2Q9D8S4 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rexo2Q9D8S4 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rexo2Q9D8S4 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rexo2Q9D8S4 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rexo2Q9D8S4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rexo2Q9D8S4 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rexo2Q9D8S4 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rexo2Q9D8S4 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rexo2Q9D8S4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rexo2Q9D8S4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rexo2Q9D8S4 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rexo2Q9D8S4 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rexo2Q9D8S4 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rexo2Q9D8S4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rexo2Q9D8S4 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms