Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8L5

Ccdc91, Coiled-coil domain-containing protein 91, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc91Q9D8L5 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc91Q9D8L5 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc91Q9D8L5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc91Q9D8L5 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc91Q9D8L5 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc91Q9D8L5 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc91Q9D8L5 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc91Q9D8L5 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc91Q9D8L5 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc91Q9D8L5 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc91Q9D8L5 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc91Q9D8L5 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc91Q9D8L5 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc91Q9D8L5 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc91Q9D8L5 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc91Q9D8L5 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc91Q9D8L5 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc91Q9D8L5 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc91Q9D8L5 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc91Q9D8L5 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc91Q9D8L5 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc91Q9D8L5 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc91Q9D8L5 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc91Q9D8L5 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc91Q9D8L5 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc91Q9D8L5 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc91Q9D8L5 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc91Q9D8L5 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc91Q9D8L5 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc91Q9D8L5 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc91Q9D8L5 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc91Q9D8L5 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc91Q9D8L5 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc91Q9D8L5 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc91Q9D8L5 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc91Q9D8L5 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc91Q9D8L5 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc91Q9D8L5 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc91Q9D8L5 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc91Q9D8L5 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc91Q9D8L5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc91Q9D8L5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc91Q9D8L5 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc91Q9D8L5 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc91Q9D8L5 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc91Q9D8L5 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc91Q9D8L5 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc91Q9D8L5 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc91Q9D8L5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc91Q9D8L5 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc91Q9D8L5 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc91Q9D8L5 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc91Q9D8L5 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc91Q9D8L5 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc91Q9D8L5 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc91Q9D8L5 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc91Q9D8L5 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc91Q9D8L5 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc91Q9D8L5 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc91Q9D8L5 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc91Q9D8L5 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc91Q9D8L5 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc91Q9D8L5 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc91Q9D8L5 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc91Q9D8L5 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc91Q9D8L5 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc91Q9D8L5 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc91Q9D8L5 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc91Q9D8L5 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc91Q9D8L5 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc91Q9D8L5 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc91Q9D8L5 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc91Q9D8L5 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc91Q9D8L5 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc91Q9D8L5 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc91Q9D8L5 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc91Q9D8L5 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc91Q9D8L5 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc91Q9D8L5 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc91Q9D8L5 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc91Q9D8L5 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc91Q9D8L5 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc91Q9D8L5 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc91Q9D8L5 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc91Q9D8L5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc91Q9D8L5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc91Q9D8L5 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc91Q9D8L5 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc91Q9D8L5 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc91Q9D8L5 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc91Q9D8L5 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc91Q9D8L5 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc91Q9D8L5 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc91Q9D8L5 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc91Q9D8L5 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc91Q9D8L5 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc91Q9D8L5 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc91Q9D8L5 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc91Q9D8L5 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc91Q9D8L5 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms