Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8D0

Tnfrsf13c, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfrsf13cQ9D8D0 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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