Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fip1l1Q9D824 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fip1l1Q9D824 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms