Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Capn9Q9D805 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Capn9Q9D805 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms