Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F9

Tubb4a, Tubulin beta-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4aQ9D6F9 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tubb4aQ9D6F9 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubb4aQ9D6F9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms