Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F4

Gabra4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra4Q9D6F4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabra4Q9D6F4 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabra4Q9D6F4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabra4Q9D6F4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabra4Q9D6F4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabra4Q9D6F4 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabra4Q9D6F4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabra4Q9D6F4 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabra4Q9D6F4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabra4Q9D6F4 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabra4Q9D6F4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabra4Q9D6F4 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabra4Q9D6F4 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabra4Q9D6F4 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabra4Q9D6F4 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabra4Q9D6F4 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabra4Q9D6F4 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabra4Q9D6F4 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabra4Q9D6F4 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabra4Q9D6F4 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabra4Q9D6F4 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabra4Q9D6F4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabra4Q9D6F4 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabra4Q9D6F4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabra4Q9D6F4 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabra4Q9D6F4 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabra4Q9D6F4 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabra4Q9D6F4 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gabra4Q9D6F4 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gabra4Q9D6F4 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gabra4Q9D6F4 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gabra4Q9D6F4 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gabra4Q9D6F4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gabra4Q9D6F4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gabra4Q9D6F4 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gabra4Q9D6F4 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gabra4Q9D6F4 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gabra4Q9D6F4 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gabra4Q9D6F4 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gabra4Q9D6F4 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gabra4Q9D6F4 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gabra4Q9D6F4 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gabra4Q9D6F4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gabra4Q9D6F4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gabra4Q9D6F4 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gabra4Q9D6F4 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gabra4Q9D6F4 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabra4Q9D6F4 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms