Protein–RNA interactions for Protein: Q9D518

Fam227b, Protein FAM227B, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam227bQ9D518 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fam227bQ9D518 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms