Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C6

Lrp2bp, LRP2-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp2bpQ9D4C6 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrp2bpQ9D4C6 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrp2bpQ9D4C6 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrp2bpQ9D4C6 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrp2bpQ9D4C6 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrp2bpQ9D4C6 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrp2bpQ9D4C6 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrp2bpQ9D4C6 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrp2bpQ9D4C6 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrp2bpQ9D4C6 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrp2bpQ9D4C6 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrp2bpQ9D4C6 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrp2bpQ9D4C6 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrp2bpQ9D4C6 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrp2bpQ9D4C6 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrp2bpQ9D4C6 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrp2bpQ9D4C6 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrp2bpQ9D4C6 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrp2bpQ9D4C6 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrp2bpQ9D4C6 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrp2bpQ9D4C6 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrp2bpQ9D4C6 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrp2bpQ9D4C6 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrp2bpQ9D4C6 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrp2bpQ9D4C6 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrp2bpQ9D4C6 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrp2bpQ9D4C6 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrp2bpQ9D4C6 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrp2bpQ9D4C6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrp2bpQ9D4C6 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrp2bpQ9D4C6 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrp2bpQ9D4C6 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrp2bpQ9D4C6 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrp2bpQ9D4C6 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrp2bpQ9D4C6 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrp2bpQ9D4C6 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrp2bpQ9D4C6 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrp2bpQ9D4C6 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrp2bpQ9D4C6 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrp2bpQ9D4C6 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrp2bpQ9D4C6 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrp2bpQ9D4C6 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrp2bpQ9D4C6 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrp2bpQ9D4C6 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrp2bpQ9D4C6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrp2bpQ9D4C6 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrp2bpQ9D4C6 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrp2bpQ9D4C6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrp2bpQ9D4C6 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrp2bpQ9D4C6 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrp2bpQ9D4C6 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrp2bpQ9D4C6 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrp2bpQ9D4C6 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrp2bpQ9D4C6 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrp2bpQ9D4C6 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrp2bpQ9D4C6 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrp2bpQ9D4C6 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrp2bpQ9D4C6 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrp2bpQ9D4C6 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrp2bpQ9D4C6 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrp2bpQ9D4C6 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrp2bpQ9D4C6 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrp2bpQ9D4C6 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrp2bpQ9D4C6 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrp2bpQ9D4C6 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrp2bpQ9D4C6 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrp2bpQ9D4C6 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrp2bpQ9D4C6 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrp2bpQ9D4C6 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrp2bpQ9D4C6 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrp2bpQ9D4C6 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrp2bpQ9D4C6 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrp2bpQ9D4C6 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrp2bpQ9D4C6 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrp2bpQ9D4C6 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrp2bpQ9D4C6 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrp2bpQ9D4C6 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrp2bpQ9D4C6 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrp2bpQ9D4C6 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrp2bpQ9D4C6 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrp2bpQ9D4C6 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrp2bpQ9D4C6 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrp2bpQ9D4C6 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrp2bpQ9D4C6 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrp2bpQ9D4C6 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrp2bpQ9D4C6 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrp2bpQ9D4C6 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrp2bpQ9D4C6 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrp2bpQ9D4C6 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrp2bpQ9D4C6 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrp2bpQ9D4C6 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms