Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Syce1Q9D495 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syce1Q9D495 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms