Protein–RNA interactions for Protein: Q9D489

Sohlh2, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh2Q9D489 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sohlh2Q9D489 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sohlh2Q9D489 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms