Protein–RNA interactions for Protein: Q9D485

Efhc2, EF-hand domain-containing family member C2, mousemouse

Predictions only

Length 750 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhc2Q9D485 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Efhc2Q9D485 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Efhc2Q9D485 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Efhc2Q9D485 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Efhc2Q9D485 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Efhc2Q9D485 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Efhc2Q9D485 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Efhc2Q9D485 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Efhc2Q9D485 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Efhc2Q9D485 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Efhc2Q9D485 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Efhc2Q9D485 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Efhc2Q9D485 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Efhc2Q9D485 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Efhc2Q9D485 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Efhc2Q9D485 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Efhc2Q9D485 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Efhc2Q9D485 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Efhc2Q9D485 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Efhc2Q9D485 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Efhc2Q9D485 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Efhc2Q9D485 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Efhc2Q9D485 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Efhc2Q9D485 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Efhc2Q9D485 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Efhc2Q9D485 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Efhc2Q9D485 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Efhc2Q9D485 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Efhc2Q9D485 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Efhc2Q9D485 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Efhc2Q9D485 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Efhc2Q9D485 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Efhc2Q9D485 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Efhc2Q9D485 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Efhc2Q9D485 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Efhc2Q9D485 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Efhc2Q9D485 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Efhc2Q9D485 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Efhc2Q9D485 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Efhc2Q9D485 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Efhc2Q9D485 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Efhc2Q9D485 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Efhc2Q9D485 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Efhc2Q9D485 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Efhc2Q9D485 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Efhc2Q9D485 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Efhc2Q9D485 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Efhc2Q9D485 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Efhc2Q9D485 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Efhc2Q9D485 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Efhc2Q9D485 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Efhc2Q9D485 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Efhc2Q9D485 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Efhc2Q9D485 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Efhc2Q9D485 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Efhc2Q9D485 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Efhc2Q9D485 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Efhc2Q9D485 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Efhc2Q9D485 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Efhc2Q9D485 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Efhc2Q9D485 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Efhc2Q9D485 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Efhc2Q9D485 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Efhc2Q9D485 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Efhc2Q9D485 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Efhc2Q9D485 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Efhc2Q9D485 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Efhc2Q9D485 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Efhc2Q9D485 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Efhc2Q9D485 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Efhc2Q9D485 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Efhc2Q9D485 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Efhc2Q9D485 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Efhc2Q9D485 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Efhc2Q9D485 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Efhc2Q9D485 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Efhc2Q9D485 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Efhc2Q9D485 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Efhc2Q9D485 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Efhc2Q9D485 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Efhc2Q9D485 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Efhc2Q9D485 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Efhc2Q9D485 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Efhc2Q9D485 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Efhc2Q9D485 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Efhc2Q9D485 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Efhc2Q9D485 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Efhc2Q9D485 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Efhc2Q9D485 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Efhc2Q9D485 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Efhc2Q9D485 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Efhc2Q9D485 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Efhc2Q9D485 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Efhc2Q9D485 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Efhc2Q9D485 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Efhc2Q9D485 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Efhc2Q9D485 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Efhc2Q9D485 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Efhc2Q9D485 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Efhc2Q9D485 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms