Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rufy3Q9D394 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rufy3Q9D394 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms