Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J3

Sarnp, SAP domain-containing ribonucleoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SarnpQ9D1J3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SarnpQ9D1J3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SarnpQ9D1J3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SarnpQ9D1J3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SarnpQ9D1J3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SarnpQ9D1J3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SarnpQ9D1J3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SarnpQ9D1J3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SarnpQ9D1J3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SarnpQ9D1J3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SarnpQ9D1J3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SarnpQ9D1J3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SarnpQ9D1J3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SarnpQ9D1J3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SarnpQ9D1J3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SarnpQ9D1J3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SarnpQ9D1J3 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SarnpQ9D1J3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SarnpQ9D1J3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SarnpQ9D1J3 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SarnpQ9D1J3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SarnpQ9D1J3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SarnpQ9D1J3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SarnpQ9D1J3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SarnpQ9D1J3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SarnpQ9D1J3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SarnpQ9D1J3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SarnpQ9D1J3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SarnpQ9D1J3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SarnpQ9D1J3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SarnpQ9D1J3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SarnpQ9D1J3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SarnpQ9D1J3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SarnpQ9D1J3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SarnpQ9D1J3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SarnpQ9D1J3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SarnpQ9D1J3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SarnpQ9D1J3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SarnpQ9D1J3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SarnpQ9D1J3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SarnpQ9D1J3 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SarnpQ9D1J3 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SarnpQ9D1J3 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SarnpQ9D1J3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SarnpQ9D1J3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SarnpQ9D1J3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SarnpQ9D1J3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SarnpQ9D1J3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SarnpQ9D1J3 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SarnpQ9D1J3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SarnpQ9D1J3 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SarnpQ9D1J3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SarnpQ9D1J3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SarnpQ9D1J3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SarnpQ9D1J3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SarnpQ9D1J3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SarnpQ9D1J3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SarnpQ9D1J3 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SarnpQ9D1J3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SarnpQ9D1J3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SarnpQ9D1J3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SarnpQ9D1J3 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SarnpQ9D1J3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SarnpQ9D1J3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SarnpQ9D1J3 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SarnpQ9D1J3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SarnpQ9D1J3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SarnpQ9D1J3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SarnpQ9D1J3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SarnpQ9D1J3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SarnpQ9D1J3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SarnpQ9D1J3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SarnpQ9D1J3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SarnpQ9D1J3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SarnpQ9D1J3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SarnpQ9D1J3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SarnpQ9D1J3 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SarnpQ9D1J3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SarnpQ9D1J3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SarnpQ9D1J3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms