Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Zbed3Q9D0L1 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Zbed3Q9D0L1 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Zbed3Q9D0L1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Zbed3Q9D0L1 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Zbed3Q9D0L1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Zbed3Q9D0L1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Zbed3Q9D0L1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Zbed3Q9D0L1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Zbed3Q9D0L1 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Zbed3Q9D0L1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Zbed3Q9D0L1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Zbed3Q9D0L1 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Zbed3Q9D0L1 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Zbed3Q9D0L1 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Zbed3Q9D0L1 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Zbed3Q9D0L1 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Zbed3Q9D0L1 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Zbed3Q9D0L1 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Zbed3Q9D0L1 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Zbed3Q9D0L1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Zbed3Q9D0L1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Zbed3Q9D0L1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Zbed3Q9D0L1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Zbed3Q9D0L1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Zbed3Q9D0L1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Zbed3Q9D0L1 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Zbed3Q9D0L1 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Zbed3Q9D0L1 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Zbed3Q9D0L1 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Zbed3Q9D0L1 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Zbed3Q9D0L1 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Zbed3Q9D0L1 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Zbed3Q9D0L1 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Zbed3Q9D0L1 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Zbed3Q9D0L1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Zbed3Q9D0L1 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Zbed3Q9D0L1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Zbed3Q9D0L1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Zbed3Q9D0L1 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Zbed3Q9D0L1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Zbed3Q9D0L1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Zbed3Q9D0L1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Zbed3Q9D0L1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Zbed3Q9D0L1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Zbed3Q9D0L1 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Zbed3Q9D0L1 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Zbed3Q9D0L1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Zbed3Q9D0L1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Zbed3Q9D0L1 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Zbed3Q9D0L1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Zbed3Q9D0L1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Zbed3Q9D0L1 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Zbed3Q9D0L1 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Zbed3Q9D0L1 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Zbed3Q9D0L1 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Zbed3Q9D0L1 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Zbed3Q9D0L1 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Zbed3Q9D0L1 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Zbed3Q9D0L1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Zbed3Q9D0L1 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Zbed3Q9D0L1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Zbed3Q9D0L1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Zbed3Q9D0L1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Zbed3Q9D0L1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Zbed3Q9D0L1 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Zbed3Q9D0L1 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Zbed3Q9D0L1 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Zbed3Q9D0L1 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Zbed3Q9D0L1 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Zbed3Q9D0L1 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Zbed3Q9D0L1 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Zbed3Q9D0L1 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Zbed3Q9D0L1 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Zbed3Q9D0L1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Zbed3Q9D0L1 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Zbed3Q9D0L1 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Zbed3Q9D0L1 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zbed3Q9D0L1 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zbed3Q9D0L1 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zbed3Q9D0L1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zbed3Q9D0L1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zbed3Q9D0L1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zbed3Q9D0L1 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zbed3Q9D0L1 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Zbed3Q9D0L1 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zbed3Q9D0L1 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zbed3Q9D0L1 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zbed3Q9D0L1 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zbed3Q9D0L1 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zbed3Q9D0L1 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zbed3Q9D0L1 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zbed3Q9D0L1 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zbed3Q9D0L1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zbed3Q9D0L1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zbed3Q9D0L1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Zbed3Q9D0L1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Zbed3Q9D0L1 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Zbed3Q9D0L1 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Zbed3Q9D0L1 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
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