Protein–RNA interactions for Protein: Q9D083

Spc24, Kinetochore protein Spc24, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spc24Q9D083 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spc24Q9D083 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spc24Q9D083 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spc24Q9D083 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Spc24Q9D083 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spc24Q9D083 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spc24Q9D083 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Spc24Q9D083 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spc24Q9D083 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spc24Q9D083 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spc24Q9D083 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spc24Q9D083 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spc24Q9D083 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spc24Q9D083 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spc24Q9D083 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spc24Q9D083 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spc24Q9D083 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spc24Q9D083 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spc24Q9D083 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spc24Q9D083 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spc24Q9D083 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spc24Q9D083 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spc24Q9D083 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spc24Q9D083 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spc24Q9D083 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spc24Q9D083 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spc24Q9D083 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spc24Q9D083 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spc24Q9D083 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spc24Q9D083 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Spc24Q9D083 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spc24Q9D083 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Spc24Q9D083 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Spc24Q9D083 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Spc24Q9D083 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Spc24Q9D083 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Spc24Q9D083 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spc24Q9D083 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spc24Q9D083 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spc24Q9D083 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spc24Q9D083 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spc24Q9D083 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spc24Q9D083 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spc24Q9D083 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spc24Q9D083 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Spc24Q9D083 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spc24Q9D083 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spc24Q9D083 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spc24Q9D083 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spc24Q9D083 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spc24Q9D083 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spc24Q9D083 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spc24Q9D083 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spc24Q9D083 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spc24Q9D083 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spc24Q9D083 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spc24Q9D083 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spc24Q9D083 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spc24Q9D083 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spc24Q9D083 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spc24Q9D083 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Spc24Q9D083 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spc24Q9D083 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spc24Q9D083 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spc24Q9D083 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spc24Q9D083 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spc24Q9D083 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spc24Q9D083 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spc24Q9D083 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spc24Q9D083 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spc24Q9D083 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spc24Q9D083 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spc24Q9D083 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spc24Q9D083 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spc24Q9D083 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spc24Q9D083 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spc24Q9D083 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spc24Q9D083 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spc24Q9D083 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spc24Q9D083 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spc24Q9D083 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Spc24Q9D083 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spc24Q9D083 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spc24Q9D083 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spc24Q9D083 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spc24Q9D083 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spc24Q9D083 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spc24Q9D083 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spc24Q9D083 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spc24Q9D083 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spc24Q9D083 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spc24Q9D083 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spc24Q9D083 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spc24Q9D083 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Spc24Q9D083 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spc24Q9D083 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spc24Q9D083 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spc24Q9D083 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spc24Q9D083 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spc24Q9D083 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms