Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ9

Dnajc18, DnaJ homolog subfamily C member 18, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc18Q9CZJ9 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dnajc18Q9CZJ9 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dnajc18Q9CZJ9 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dnajc18Q9CZJ9 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dnajc18Q9CZJ9 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dnajc18Q9CZJ9 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dnajc18Q9CZJ9 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dnajc18Q9CZJ9 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dnajc18Q9CZJ9 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dnajc18Q9CZJ9 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dnajc18Q9CZJ9 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dnajc18Q9CZJ9 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dnajc18Q9CZJ9 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dnajc18Q9CZJ9 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dnajc18Q9CZJ9 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dnajc18Q9CZJ9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dnajc18Q9CZJ9 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dnajc18Q9CZJ9 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Dnajc18Q9CZJ9 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dnajc18Q9CZJ9 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dnajc18Q9CZJ9 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dnajc18Q9CZJ9 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dnajc18Q9CZJ9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dnajc18Q9CZJ9 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dnajc18Q9CZJ9 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dnajc18Q9CZJ9 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dnajc18Q9CZJ9 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dnajc18Q9CZJ9 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dnajc18Q9CZJ9 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dnajc18Q9CZJ9 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dnajc18Q9CZJ9 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dnajc18Q9CZJ9 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dnajc18Q9CZJ9 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dnajc18Q9CZJ9 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Dnajc18Q9CZJ9 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dnajc18Q9CZJ9 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dnajc18Q9CZJ9 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dnajc18Q9CZJ9 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dnajc18Q9CZJ9 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Dnajc18Q9CZJ9 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Dnajc18Q9CZJ9 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dnajc18Q9CZJ9 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dnajc18Q9CZJ9 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dnajc18Q9CZJ9 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dnajc18Q9CZJ9 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Dnajc18Q9CZJ9 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dnajc18Q9CZJ9 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dnajc18Q9CZJ9 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dnajc18Q9CZJ9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dnajc18Q9CZJ9 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Dnajc18Q9CZJ9 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dnajc18Q9CZJ9 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dnajc18Q9CZJ9 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dnajc18Q9CZJ9 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Dnajc18Q9CZJ9 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dnajc18Q9CZJ9 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dnajc18Q9CZJ9 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dnajc18Q9CZJ9 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dnajc18Q9CZJ9 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dnajc18Q9CZJ9 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dnajc18Q9CZJ9 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dnajc18Q9CZJ9 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dnajc18Q9CZJ9 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dnajc18Q9CZJ9 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dnajc18Q9CZJ9 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dnajc18Q9CZJ9 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dnajc18Q9CZJ9 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Dnajc18Q9CZJ9 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dnajc18Q9CZJ9 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dnajc18Q9CZJ9 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dnajc18Q9CZJ9 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dnajc18Q9CZJ9 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dnajc18Q9CZJ9 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dnajc18Q9CZJ9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dnajc18Q9CZJ9 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dnajc18Q9CZJ9 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dnajc18Q9CZJ9 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dnajc18Q9CZJ9 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dnajc18Q9CZJ9 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dnajc18Q9CZJ9 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dnajc18Q9CZJ9 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Dnajc18Q9CZJ9 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Dnajc18Q9CZJ9 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dnajc18Q9CZJ9 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dnajc18Q9CZJ9 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dnajc18Q9CZJ9 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dnajc18Q9CZJ9 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dnajc18Q9CZJ9 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Dnajc18Q9CZJ9 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dnajc18Q9CZJ9 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dnajc18Q9CZJ9 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dnajc18Q9CZJ9 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dnajc18Q9CZJ9 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dnajc18Q9CZJ9 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dnajc18Q9CZJ9 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dnajc18Q9CZJ9 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dnajc18Q9CZJ9 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dnajc18Q9CZJ9 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dnajc18Q9CZJ9 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dnajc18Q9CZJ9 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms