Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ91

Srfbp1, Serum response factor-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srfbp1Q9CZ91 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Srfbp1Q9CZ91 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srfbp1Q9CZ91 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srfbp1Q9CZ91 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srfbp1Q9CZ91 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srfbp1Q9CZ91 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srfbp1Q9CZ91 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srfbp1Q9CZ91 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srfbp1Q9CZ91 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srfbp1Q9CZ91 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srfbp1Q9CZ91 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srfbp1Q9CZ91 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srfbp1Q9CZ91 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srfbp1Q9CZ91 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srfbp1Q9CZ91 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srfbp1Q9CZ91 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srfbp1Q9CZ91 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srfbp1Q9CZ91 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srfbp1Q9CZ91 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Srfbp1Q9CZ91 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms