Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms