Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXZ1

Ndufs4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs4Q9CXZ1 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndufs4Q9CXZ1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ndufs4Q9CXZ1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufs4Q9CXZ1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms