Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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Sgo1Q9CXH7 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Sgo1Q9CXH7 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgo1Q9CXH7 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgo1Q9CXH7 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgo1Q9CXH7 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Sgo1Q9CXH7 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgo1Q9CXH7 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgo1Q9CXH7 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Sgo1Q9CXH7 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Sgo1Q9CXH7 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sgo1Q9CXH7 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Sgo1Q9CXH7 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sgo1Q9CXH7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sgo1Q9CXH7 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sgo1Q9CXH7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Sgo1Q9CXH7 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Sgo1Q9CXH7 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sgo1Q9CXH7 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sgo1Q9CXH7 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sgo1Q9CXH7 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Sgo1Q9CXH7 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Sgo1Q9CXH7 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Sgo1Q9CXH7 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Sgo1Q9CXH7 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Sgo1Q9CXH7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Sgo1Q9CXH7 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Sgo1Q9CXH7 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sgo1Q9CXH7 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sgo1Q9CXH7 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sgo1Q9CXH7 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sgo1Q9CXH7 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sgo1Q9CXH7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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