Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RpainQ9CWY9 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms