Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prkrip1Q9CWV6 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Prkrip1Q9CWV6 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Prkrip1Q9CWV6 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Prkrip1Q9CWV6 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Prkrip1Q9CWV6 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Prkrip1Q9CWV6 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prkrip1Q9CWV6 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prkrip1Q9CWV6 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prkrip1Q9CWV6 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prkrip1Q9CWV6 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prkrip1Q9CWV6 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prkrip1Q9CWV6 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prkrip1Q9CWV6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prkrip1Q9CWV6 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prkrip1Q9CWV6 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prkrip1Q9CWV6 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prkrip1Q9CWV6 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prkrip1Q9CWV6 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prkrip1Q9CWV6 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prkrip1Q9CWV6 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prkrip1Q9CWV6 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prkrip1Q9CWV6 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prkrip1Q9CWV6 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prkrip1Q9CWV6 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prkrip1Q9CWV6 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prkrip1Q9CWV6 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prkrip1Q9CWV6 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prkrip1Q9CWV6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prkrip1Q9CWV6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prkrip1Q9CWV6 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prkrip1Q9CWV6 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prkrip1Q9CWV6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prkrip1Q9CWV6 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prkrip1Q9CWV6 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prkrip1Q9CWV6 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prkrip1Q9CWV6 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prkrip1Q9CWV6 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prkrip1Q9CWV6 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prkrip1Q9CWV6 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prkrip1Q9CWV6 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prkrip1Q9CWV6 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prkrip1Q9CWV6 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prkrip1Q9CWV6 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prkrip1Q9CWV6 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prkrip1Q9CWV6 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prkrip1Q9CWV6 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prkrip1Q9CWV6 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prkrip1Q9CWV6 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Prkrip1Q9CWV6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prkrip1Q9CWV6 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prkrip1Q9CWV6 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prkrip1Q9CWV6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prkrip1Q9CWV6 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prkrip1Q9CWV6 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prkrip1Q9CWV6 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prkrip1Q9CWV6 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prkrip1Q9CWV6 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prkrip1Q9CWV6 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Prkrip1Q9CWV6 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prkrip1Q9CWV6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prkrip1Q9CWV6 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prkrip1Q9CWV6 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prkrip1Q9CWV6 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prkrip1Q9CWV6 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prkrip1Q9CWV6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Prkrip1Q9CWV6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prkrip1Q9CWV6 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Prkrip1Q9CWV6 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prkrip1Q9CWV6 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prkrip1Q9CWV6 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prkrip1Q9CWV6 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prkrip1Q9CWV6 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prkrip1Q9CWV6 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prkrip1Q9CWV6 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prkrip1Q9CWV6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prkrip1Q9CWV6 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prkrip1Q9CWV6 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prkrip1Q9CWV6 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prkrip1Q9CWV6 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prkrip1Q9CWV6 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prkrip1Q9CWV6 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prkrip1Q9CWV6 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prkrip1Q9CWV6 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prkrip1Q9CWV6 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prkrip1Q9CWV6 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prkrip1Q9CWV6 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prkrip1Q9CWV6 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prkrip1Q9CWV6 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prkrip1Q9CWV6 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prkrip1Q9CWV6 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prkrip1Q9CWV6 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Prkrip1Q9CWV6 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Prkrip1Q9CWV6 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Prkrip1Q9CWV6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Prkrip1Q9CWV6 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Prkrip1Q9CWV6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Prkrip1Q9CWV6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Prkrip1Q9CWV6 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Prkrip1Q9CWV6 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms