Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU4

UPF0690 protein C1orf52 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CWU4 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Q9CWU4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CWU4 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CWU4 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CWU4 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CWU4 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9CWU4 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms