Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM2

Cdca4, Cell division cycle-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca4Q9CWM2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdca4Q9CWM2 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdca4Q9CWM2 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdca4Q9CWM2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdca4Q9CWM2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdca4Q9CWM2 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdca4Q9CWM2 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdca4Q9CWM2 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdca4Q9CWM2 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdca4Q9CWM2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdca4Q9CWM2 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdca4Q9CWM2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdca4Q9CWM2 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdca4Q9CWM2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdca4Q9CWM2 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdca4Q9CWM2 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdca4Q9CWM2 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdca4Q9CWM2 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdca4Q9CWM2 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdca4Q9CWM2 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms