Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

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Length 355 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
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Atxn3Q9CVD2 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Atxn3Q9CVD2 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atxn3Q9CVD2 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Atxn3Q9CVD2 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Atxn3Q9CVD2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atxn3Q9CVD2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atxn3Q9CVD2 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atxn3Q9CVD2 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atxn3Q9CVD2 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atxn3Q9CVD2 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Atxn3Q9CVD2 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atxn3Q9CVD2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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Atxn3Q9CVD2 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atxn3Q9CVD2 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atxn3Q9CVD2 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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Atxn3Q9CVD2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atxn3Q9CVD2 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atxn3Q9CVD2 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
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Atxn3Q9CVD2 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atxn3Q9CVD2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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Atxn3Q9CVD2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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Atxn3Q9CVD2 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atxn3Q9CVD2 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atxn3Q9CVD2 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atxn3Q9CVD2 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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Atxn3Q9CVD2 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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Atxn3Q9CVD2 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atxn3Q9CVD2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atxn3Q9CVD2 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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Atxn3Q9CVD2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atxn3Q9CVD2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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Atxn3Q9CVD2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atxn3Q9CVD2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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Atxn3Q9CVD2 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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Atxn3Q9CVD2 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atxn3Q9CVD2 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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Atxn3Q9CVD2 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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Atxn3Q9CVD2 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atxn3Q9CVD2 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atxn3Q9CVD2 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atxn3Q9CVD2 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atxn3Q9CVD2 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atxn3Q9CVD2 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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Atxn3Q9CVD2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atxn3Q9CVD2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atxn3Q9CVD2 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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Atxn3Q9CVD2 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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