Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC9

Gnpda2, Glucosamine-6-phosphate isomerase 2, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnpda2Q9CRC9 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gnpda2Q9CRC9 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gnpda2Q9CRC9 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gnpda2Q9CRC9 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gnpda2Q9CRC9 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gnpda2Q9CRC9 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gnpda2Q9CRC9 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gnpda2Q9CRC9 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gnpda2Q9CRC9 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gnpda2Q9CRC9 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gnpda2Q9CRC9 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gnpda2Q9CRC9 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gnpda2Q9CRC9 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gnpda2Q9CRC9 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gnpda2Q9CRC9 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gnpda2Q9CRC9 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gnpda2Q9CRC9 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gnpda2Q9CRC9 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gnpda2Q9CRC9 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gnpda2Q9CRC9 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gnpda2Q9CRC9 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gnpda2Q9CRC9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gnpda2Q9CRC9 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gnpda2Q9CRC9 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gnpda2Q9CRC9 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gnpda2Q9CRC9 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gnpda2Q9CRC9 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gnpda2Q9CRC9 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gnpda2Q9CRC9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gnpda2Q9CRC9 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gnpda2Q9CRC9 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gnpda2Q9CRC9 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gnpda2Q9CRC9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gnpda2Q9CRC9 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gnpda2Q9CRC9 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gnpda2Q9CRC9 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gnpda2Q9CRC9 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gnpda2Q9CRC9 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gnpda2Q9CRC9 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gnpda2Q9CRC9 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gnpda2Q9CRC9 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gnpda2Q9CRC9 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gnpda2Q9CRC9 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gnpda2Q9CRC9 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gnpda2Q9CRC9 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gnpda2Q9CRC9 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gnpda2Q9CRC9 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gnpda2Q9CRC9 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gnpda2Q9CRC9 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gnpda2Q9CRC9 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gnpda2Q9CRC9 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gnpda2Q9CRC9 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gnpda2Q9CRC9 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gnpda2Q9CRC9 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gnpda2Q9CRC9 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gnpda2Q9CRC9 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gnpda2Q9CRC9 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gnpda2Q9CRC9 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gnpda2Q9CRC9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gnpda2Q9CRC9 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gnpda2Q9CRC9 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gnpda2Q9CRC9 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gnpda2Q9CRC9 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gnpda2Q9CRC9 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gnpda2Q9CRC9 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gnpda2Q9CRC9 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gnpda2Q9CRC9 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gnpda2Q9CRC9 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gnpda2Q9CRC9 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gnpda2Q9CRC9 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gnpda2Q9CRC9 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gnpda2Q9CRC9 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gnpda2Q9CRC9 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gnpda2Q9CRC9 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gnpda2Q9CRC9 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gnpda2Q9CRC9 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gnpda2Q9CRC9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gnpda2Q9CRC9 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gnpda2Q9CRC9 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gnpda2Q9CRC9 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gnpda2Q9CRC9 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gnpda2Q9CRC9 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gnpda2Q9CRC9 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gnpda2Q9CRC9 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gnpda2Q9CRC9 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gnpda2Q9CRC9 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gnpda2Q9CRC9 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gnpda2Q9CRC9 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gnpda2Q9CRC9 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gnpda2Q9CRC9 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gnpda2Q9CRC9 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gnpda2Q9CRC9 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gnpda2Q9CRC9 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gnpda2Q9CRC9 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gnpda2Q9CRC9 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gnpda2Q9CRC9 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gnpda2Q9CRC9 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gnpda2Q9CRC9 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gnpda2Q9CRC9 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gnpda2Q9CRC9 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms