Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR46

Ska2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska2Q9CR46 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ska2Q9CR46 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ska2Q9CR46 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ska2Q9CR46 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ska2Q9CR46 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ska2Q9CR46 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ska2Q9CR46 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ska2Q9CR46 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ska2Q9CR46 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ska2Q9CR46 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ska2Q9CR46 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ska2Q9CR46 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ska2Q9CR46 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ska2Q9CR46 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ska2Q9CR46 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ska2Q9CR46 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ska2Q9CR46 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ska2Q9CR46 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ska2Q9CR46 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ska2Q9CR46 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ska2Q9CR46 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ska2Q9CR46 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ska2Q9CR46 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ska2Q9CR46 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ska2Q9CR46 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ska2Q9CR46 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ska2Q9CR46 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ska2Q9CR46 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ska2Q9CR46 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ska2Q9CR46 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ska2Q9CR46 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ska2Q9CR46 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ska2Q9CR46 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ska2Q9CR46 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ska2Q9CR46 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ska2Q9CR46 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ska2Q9CR46 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ska2Q9CR46 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ska2Q9CR46 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ska2Q9CR46 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ska2Q9CR46 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ska2Q9CR46 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ska2Q9CR46 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ska2Q9CR46 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ska2Q9CR46 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ska2Q9CR46 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ska2Q9CR46 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ska2Q9CR46 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ska2Q9CR46 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ska2Q9CR46 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ska2Q9CR46 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ska2Q9CR46 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ska2Q9CR46 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ska2Q9CR46 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ska2Q9CR46 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ska2Q9CR46 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ska2Q9CR46 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ska2Q9CR46 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ska2Q9CR46 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ska2Q9CR46 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ska2Q9CR46 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ska2Q9CR46 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ska2Q9CR46 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ska2Q9CR46 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ska2Q9CR46 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ska2Q9CR46 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ska2Q9CR46 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ska2Q9CR46 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ska2Q9CR46 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ska2Q9CR46 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ska2Q9CR46 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms