Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX4

Pclaf, PCNA-associated factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PclafQ9CQX4 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PclafQ9CQX4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PclafQ9CQX4 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PclafQ9CQX4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PclafQ9CQX4 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PclafQ9CQX4 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PclafQ9CQX4 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PclafQ9CQX4 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PclafQ9CQX4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PclafQ9CQX4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PclafQ9CQX4 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PclafQ9CQX4 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PclafQ9CQX4 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PclafQ9CQX4 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PclafQ9CQX4 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PclafQ9CQX4 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PclafQ9CQX4 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PclafQ9CQX4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PclafQ9CQX4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms