Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smim8Q9CQQ0 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smim8Q9CQQ0 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms